马尾松内参基因序列的筛选及引物设计开题报告

1. 本选题研究的目的及意义

内参基因，又称管家基因，在生物体内大多数组织和细胞中都呈组成性表达，其表达水平不受外界环境因素的影响，具有高度的时空特异性。

在基因表达研究中，内参基因通常作为标准，用于校正和标准化目标基因的表达水平，以消除系统误差，提高实验结果的可靠性和准确性。

马尾松（pinusmassonianalamb.）是我国重要的乡土针叶树种，具有分布范围广、适应性强、经济价值高等特点，在我国林业生产和生态建设中占有重要地位。

2. 本选题国内外研究状况综述

近年来，随着分子生物学技术的快速发展，内参基因的筛选及应用已成为研究热点。

国内外学者对多种植物的内参基因进行了广泛研究，并筛选出了一些常用的内参基因，如act、tub、gapdh、18srrna等。

1. 国内研究现状

3. 本选题研究的主要内容及写作提纲

本研究将以马尾松为研究对象，利用生物信息学和分子生物学技术，筛选表达稳定性高的内参基因，并设计特异性引物。

1. 主要内容

1.收集马尾松不同组织（根、茎、叶等）和不同逆境胁迫（干旱、盐碱、高温等）下的转录组数据。

4. 研究的方法与步骤

本研究将采用生物信息学和分子生物学相结合的研究方法。

1.数据获取与处理：从公共数据库下载马尾松不同组织、不同处理条件下的转录组数据，利用生物信息学软件对数据进行质量控制、过滤和标准化处理。

2.候选内参基因筛选：根据已有研究基础，选择10-15个常用的植物内参基因作为候选基因，并利用生物信息学工具对候选基因的序列特征、保守结构域进行分析。

5. 研究的创新点

1.本研究将利用生物信息学和分子生物学技术相结合的方法，对马尾松内参基因进行筛选，与传统方法相比，筛选范围更广，结果更准确可靠。

2.本研究将结合马尾松的生长发育特点和逆境胁迫类型，筛选适用于不同研究目的的内参基因，为马尾松基因表达分析提供更精准的参考依据。

3.本研究将设计并验证马尾松内参基因的特异性引物，为马尾松基因表达分析提供更便捷高效的技术手段。

6. 计划与进度安排

第一阶段 （2024.12~2024.1）确认选题，了解毕业论文的相关步骤。

第二阶段（2024.1~2024.2）查询阅读相关文献，列出提纲

第三阶段（2024.2~2024.3）查询资料，学习相关论文

7. 参考文献（20个中文5个英文）

[1] 张晓燕, 王贤荣, 彭镇华, 等. 基于转录组测序筛选云南松候选内参基因[j]. 林业科学, 2018, 54(12): 75-86.

[2] 王云鹤, 张建国, 刘艳, 等. 基于rna-seq技术筛选罗汉果高表达基因及内参基因[j]. 分子植物育种, 2021, 19(16): 5461-5471.

[3] 李玲, 刘超, 刘洋, 等. 基于rna-seq技术的青钱柳性别差异表达基因及内参基因筛选[j]. 林业科学, 2021, 57(11): 127-137.